Hoa Gian Lệnh xoay quanh một câu chuyện tình yêu đầy bi kịch giữa Phan Việt và Dương Thải Vi, hai nhân vật chính trong bộ phim. Phan Việt, huyện lệnh được ngưỡng mộ như idol quốc dân, bị ép buộc phải kết hôn với Dương Thải Vi - một người bị xã hội đánh đồng. Tuy nhiên, vào đêm định mệnh, Dương Thải Vi biến mất và trở lại dưới danh tính mới là Thượng Quan Chỉ. Hai nhân vật phải cùng nhau khám phá bí ẩn, lật tẩy sự thật và tìm ra hung thủ thực sự để giữ cho tình yêu của họ không bị tan vỡ.